政府在食品安全體系建設與運行中扮演重要角色，但是，農產(chǎn)品食品安全工作僅僅靠政府是遠遠不夠的。在歐美等發(fā)達國家，通過(guò)第三方認證機構的認證活動(dòng)來(lái)加強農產(chǎn)品、食品生產(chǎn)和經(jīng)營(yíng)企業(yè)安全體系的建設已經(jīng)成為保障食品安全的重要手段，同時(shí)也降低了行政成本，有利于分散行政風(fēng)險。
我國《農產(chǎn)品質(zhì)量安全法》已經(jīng)于2006年11月1日實(shí)行，為保障農產(chǎn)品質(zhì)量安全，維護公眾健康，促進(jìn)農業(yè)和農村經(jīng)濟發(fā)展提供了法律保證?！掇r產(chǎn)品質(zhì)量安全法》在第8條和第9條中，明確指出國家引導、推廣標準化生產(chǎn)，鼓勵和支持生產(chǎn)優(yōu)質(zhì)農產(chǎn)品，推行科學(xué)的質(zhì)量管理辦法。
認證是當前國際通行的農產(chǎn)品和食品質(zhì)量安全管理手段，其最具有特色且起著(zhù)重要作用的功能在于：
一是有利于推進(jìn)標準化的貫徹實(shí)施，便于規范農產(chǎn)品種養過(guò)程及食品加工、銷(xiāo)售等環(huán)節，促使農產(chǎn)品及食品的生產(chǎn)者、經(jīng)營(yíng)者及相關(guān)管理者樹(shù)立標準意識和質(zhì)量意識。
二是判定農產(chǎn)品、食品是否符合標準，是由處于公正地位的專(zhuān)業(yè)化的認證機構作出的。它以不同于農產(chǎn)品種植、養殖方和食品加工方（即第一方）與批發(fā)商、經(jīng)銷(xiāo)商（即第二方）的第三方身份，對獲得認證的產(chǎn)品持續符合標準和技術(shù)規范的要求提供證明，并承擔保障認證結果公正和有效的責任。
三是有利于解決當前國際農產(chǎn)品及食品貿易遇到的技術(shù)壁壘，通過(guò)農產(chǎn)品、食品認證的國際互認，便于我國農產(chǎn)品、食品順利走出國門(mén)。
四是開(kāi)展認證適應了政府職能轉變和機構改革形勢，有利于政府從直接實(shí)施產(chǎn)品質(zhì)量安全檢驗檢測等行政審批性質(zhì)（直接承擔著(zhù)質(zhì)量安全的責任）的工作中解脫出來(lái)，減少政府的責任和風(fēng)險，因而對于深化行政管理體制改革，提高政府效能，從源頭上預防和治理腐敗，也具有重要意義。
目前，我國管理農產(chǎn)品、食品質(zhì)量安全的方式方法有很多。專(zhuān)家建議，應對我國農產(chǎn)品認證制度進(jìn)行整合，按照農產(chǎn)品、食品生產(chǎn)供應鏈建立我國農產(chǎn)品和食品質(zhì)量安全認證的框架。同時(shí)，實(shí)施現有的無(wú)公害農產(chǎn)品、綠色食品、有機食品認證制度，既滿(mǎn)足一般消費者對質(zhì)量安全的基本要求，又適應不同消費層次比較高的要求。
